Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D2

4933402E13Rik, 4933402E13Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402E13RikQ9D4D2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
4933402E13RikQ9D4D2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4933402E13RikQ9D4D2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
4933402E13RikQ9D4D2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4933402E13RikQ9D4D2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4933402E13RikQ9D4D2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4933402E13RikQ9D4D2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4933402E13RikQ9D4D2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 211.5 ms