Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms