Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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