Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rnf17Q99MV7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rnf17Q99MV7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rnf17Q99MV7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rnf17Q99MV7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rnf17Q99MV7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Rnf17Q99MV7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rnf17Q99MV7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rnf17Q99MV7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Rnf17Q99MV7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rnf17Q99MV7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rnf17Q99MV7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Rnf17Q99MV7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rnf17Q99MV7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rnf17Q99MV7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rnf17Q99MV7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rnf17Q99MV7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rnf17Q99MV7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rnf17Q99MV7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rnf17Q99MV7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rnf17Q99MV7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rnf17Q99MV7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rnf17Q99MV7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rnf17Q99MV7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rnf17Q99MV7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Rnf17Q99MV7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rnf17Q99MV7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rnf17Q99MV7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rnf17Q99MV7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rnf17Q99MV7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rnf17Q99MV7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rnf17Q99MV7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rnf17Q99MV7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rnf17Q99MV7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Rnf17Q99MV7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rnf17Q99MV7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Rnf17Q99MV7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rnf17Q99MV7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rnf17Q99MV7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rnf17Q99MV7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rnf17Q99MV7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rnf17Q99MV7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rnf17Q99MV7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rnf17Q99MV7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rnf17Q99MV7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rnf17Q99MV7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rnf17Q99MV7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rnf17Q99MV7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Rnf17Q99MV7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rnf17Q99MV7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rnf17Q99MV7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rnf17Q99MV7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rnf17Q99MV7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rnf17Q99MV7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rnf17Q99MV7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rnf17Q99MV7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rnf17Q99MV7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rnf17Q99MV7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Rnf17Q99MV7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rnf17Q99MV7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rnf17Q99MV7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rnf17Q99MV7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Rnf17Q99MV7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rnf17Q99MV7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Rnf17Q99MV7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rnf17Q99MV7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rnf17Q99MV7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rnf17Q99MV7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rnf17Q99MV7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Rnf17Q99MV7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rnf17Q99MV7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rnf17Q99MV7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rnf17Q99MV7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rnf17Q99MV7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Rnf17Q99MV7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rnf17Q99MV7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rnf17Q99MV7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rnf17Q99MV7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rnf17Q99MV7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rnf17Q99MV7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Rnf17Q99MV7 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Rnf17Q99MV7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rnf17Q99MV7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rnf17Q99MV7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rnf17Q99MV7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Rnf17Q99MV7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rnf17Q99MV7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rnf17Q99MV7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rnf17Q99MV7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rnf17Q99MV7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rnf17Q99MV7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Rnf17Q99MV7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rnf17Q99MV7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rnf17Q99MV7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rnf17Q99MV7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rnf17Q99MV7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rnf17Q99MV7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rnf17Q99MV7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rnf17Q99MV7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rnf17Q99MV7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms