Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtpbp4Q99ME9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms