Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms