Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ3

Dkk4, Dickkopf-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk4Q8VEJ3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dkk4Q8VEJ3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dkk4Q8VEJ3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Dkk4Q8VEJ3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dkk4Q8VEJ3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dkk4Q8VEJ3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dkk4Q8VEJ3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dkk4Q8VEJ3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dkk4Q8VEJ3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Dkk4Q8VEJ3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dkk4Q8VEJ3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dkk4Q8VEJ3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dkk4Q8VEJ3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dkk4Q8VEJ3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dkk4Q8VEJ3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dkk4Q8VEJ3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dkk4Q8VEJ3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Dkk4Q8VEJ3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dkk4Q8VEJ3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dkk4Q8VEJ3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dkk4Q8VEJ3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dkk4Q8VEJ3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dkk4Q8VEJ3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dkk4Q8VEJ3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dkk4Q8VEJ3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Dkk4Q8VEJ3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dkk4Q8VEJ3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dkk4Q8VEJ3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dkk4Q8VEJ3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dkk4Q8VEJ3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dkk4Q8VEJ3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dkk4Q8VEJ3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dkk4Q8VEJ3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dkk4Q8VEJ3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dkk4Q8VEJ3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dkk4Q8VEJ3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dkk4Q8VEJ3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dkk4Q8VEJ3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dkk4Q8VEJ3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Dkk4Q8VEJ3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dkk4Q8VEJ3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dkk4Q8VEJ3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dkk4Q8VEJ3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms