Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrit1Q8K099 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrit1Q8K099 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrit1Q8K099 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrit1Q8K099 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrit1Q8K099 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrit1Q8K099 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrit1Q8K099 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrit1Q8K099 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrit1Q8K099 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrit1Q8K099 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrit1Q8K099 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrit1Q8K099 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrit1Q8K099 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrit1Q8K099 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrit1Q8K099 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrit1Q8K099 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrit1Q8K099 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrit1Q8K099 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrit1Q8K099 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lrit1Q8K099 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lrit1Q8K099 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lrit1Q8K099 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lrit1Q8K099 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lrit1Q8K099 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lrit1Q8K099 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Lrit1Q8K099 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lrit1Q8K099 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrit1Q8K099 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrit1Q8K099 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrit1Q8K099 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrit1Q8K099 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrit1Q8K099 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrit1Q8K099 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrit1Q8K099 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrit1Q8K099 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrit1Q8K099 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrit1Q8K099 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrit1Q8K099 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrit1Q8K099 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrit1Q8K099 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrit1Q8K099 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrit1Q8K099 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrit1Q8K099 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrit1Q8K099 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrit1Q8K099 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrit1Q8K099 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrit1Q8K099 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrit1Q8K099 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrit1Q8K099 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrit1Q8K099 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrit1Q8K099 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrit1Q8K099 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrit1Q8K099 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrit1Q8K099 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrit1Q8K099 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrit1Q8K099 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrit1Q8K099 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrit1Q8K099 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrit1Q8K099 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrit1Q8K099 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrit1Q8K099 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrit1Q8K099 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrit1Q8K099 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrit1Q8K099 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrit1Q8K099 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrit1Q8K099 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrit1Q8K099 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrit1Q8K099 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrit1Q8K099 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrit1Q8K099 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrit1Q8K099 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrit1Q8K099 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrit1Q8K099 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrit1Q8K099 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrit1Q8K099 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrit1Q8K099 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrit1Q8K099 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrit1Q8K099 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrit1Q8K099 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrit1Q8K099 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrit1Q8K099 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrit1Q8K099 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrit1Q8K099 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrit1Q8K099 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrit1Q8K099 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lrit1Q8K099 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lrit1Q8K099 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lrit1Q8K099 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrit1Q8K099 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrit1Q8K099 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrit1Q8K099 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrit1Q8K099 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrit1Q8K099 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrit1Q8K099 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrit1Q8K099 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrit1Q8K099 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrit1Q8K099 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrit1Q8K099 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrit1Q8K099 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms