Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg4dQ8BGV9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg4dQ8BGV9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg4dQ8BGV9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg4dQ8BGV9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg4dQ8BGV9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg4dQ8BGV9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg4dQ8BGV9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg4dQ8BGV9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg4dQ8BGV9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg4dQ8BGV9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg4dQ8BGV9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg4dQ8BGV9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg4dQ8BGV9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg4dQ8BGV9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg4dQ8BGV9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg4dQ8BGV9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg4dQ8BGV9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg4dQ8BGV9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg4dQ8BGV9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg4dQ8BGV9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg4dQ8BGV9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg4dQ8BGV9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg4dQ8BGV9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg4dQ8BGV9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg4dQ8BGV9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg4dQ8BGV9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.7 ms