Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms