Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDI5

Ecm29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm29Q6PDI5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ecm29Q6PDI5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ecm29Q6PDI5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ecm29Q6PDI5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ecm29Q6PDI5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ecm29Q6PDI5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ecm29Q6PDI5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ecm29Q6PDI5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ecm29Q6PDI5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ecm29Q6PDI5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ecm29Q6PDI5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ecm29Q6PDI5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ecm29Q6PDI5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ecm29Q6PDI5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ecm29Q6PDI5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ecm29Q6PDI5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ecm29Q6PDI5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ecm29Q6PDI5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ecm29Q6PDI5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ecm29Q6PDI5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ecm29Q6PDI5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ecm29Q6PDI5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ecm29Q6PDI5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ecm29Q6PDI5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ecm29Q6PDI5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ecm29Q6PDI5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ecm29Q6PDI5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ecm29Q6PDI5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ecm29Q6PDI5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ecm29Q6PDI5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ecm29Q6PDI5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ecm29Q6PDI5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ecm29Q6PDI5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ecm29Q6PDI5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ecm29Q6PDI5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ecm29Q6PDI5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ecm29Q6PDI5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ecm29Q6PDI5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ecm29Q6PDI5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ecm29Q6PDI5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ecm29Q6PDI5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ecm29Q6PDI5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ecm29Q6PDI5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ecm29Q6PDI5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ecm29Q6PDI5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ecm29Q6PDI5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ecm29Q6PDI5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ecm29Q6PDI5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ecm29Q6PDI5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ecm29Q6PDI5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ecm29Q6PDI5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ecm29Q6PDI5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ecm29Q6PDI5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ecm29Q6PDI5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ecm29Q6PDI5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ecm29Q6PDI5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ecm29Q6PDI5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ecm29Q6PDI5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ecm29Q6PDI5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ecm29Q6PDI5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ecm29Q6PDI5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ecm29Q6PDI5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ecm29Q6PDI5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ecm29Q6PDI5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ecm29Q6PDI5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ecm29Q6PDI5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ecm29Q6PDI5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ecm29Q6PDI5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ecm29Q6PDI5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ecm29Q6PDI5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ecm29Q6PDI5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ecm29Q6PDI5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ecm29Q6PDI5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ecm29Q6PDI5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ecm29Q6PDI5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ecm29Q6PDI5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ecm29Q6PDI5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ecm29Q6PDI5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ecm29Q6PDI5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ecm29Q6PDI5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ecm29Q6PDI5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ecm29Q6PDI5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ecm29Q6PDI5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ecm29Q6PDI5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ecm29Q6PDI5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ecm29Q6PDI5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ecm29Q6PDI5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ecm29Q6PDI5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ecm29Q6PDI5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ecm29Q6PDI5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ecm29Q6PDI5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ecm29Q6PDI5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ecm29Q6PDI5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ecm29Q6PDI5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ecm29Q6PDI5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ecm29Q6PDI5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ecm29Q6PDI5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ecm29Q6PDI5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ecm29Q6PDI5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ecm29Q6PDI5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.4 ms