Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zbtb40Q6PCS8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zbtb40Q6PCS8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zbtb40Q6PCS8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Zbtb40Q6PCS8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Zbtb40Q6PCS8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zbtb40Q6PCS8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zbtb40Q6PCS8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zbtb40Q6PCS8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zbtb40Q6PCS8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zbtb40Q6PCS8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zbtb40Q6PCS8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zbtb40Q6PCS8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zbtb40Q6PCS8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zbtb40Q6PCS8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zbtb40Q6PCS8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zbtb40Q6PCS8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zbtb40Q6PCS8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zbtb40Q6PCS8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zbtb40Q6PCS8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zbtb40Q6PCS8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zbtb40Q6PCS8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zbtb40Q6PCS8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zbtb40Q6PCS8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zbtb40Q6PCS8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zbtb40Q6PCS8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Zbtb40Q6PCS8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Zbtb40Q6PCS8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zbtb40Q6PCS8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zbtb40Q6PCS8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zbtb40Q6PCS8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zbtb40Q6PCS8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zbtb40Q6PCS8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zbtb40Q6PCS8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zbtb40Q6PCS8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zbtb40Q6PCS8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zbtb40Q6PCS8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zbtb40Q6PCS8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zbtb40Q6PCS8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zbtb40Q6PCS8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zbtb40Q6PCS8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zbtb40Q6PCS8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zbtb40Q6PCS8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zbtb40Q6PCS8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zbtb40Q6PCS8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Zbtb40Q6PCS8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Zbtb40Q6PCS8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zbtb40Q6PCS8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zbtb40Q6PCS8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zbtb40Q6PCS8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zbtb40Q6PCS8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zbtb40Q6PCS8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zbtb40Q6PCS8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zbtb40Q6PCS8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zbtb40Q6PCS8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zbtb40Q6PCS8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zbtb40Q6PCS8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zbtb40Q6PCS8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zbtb40Q6PCS8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zbtb40Q6PCS8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zbtb40Q6PCS8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zbtb40Q6PCS8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zbtb40Q6PCS8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zbtb40Q6PCS8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zbtb40Q6PCS8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zbtb40Q6PCS8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zbtb40Q6PCS8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zbtb40Q6PCS8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zbtb40Q6PCS8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zbtb40Q6PCS8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zbtb40Q6PCS8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zbtb40Q6PCS8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Zbtb40Q6PCS8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zbtb40Q6PCS8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zbtb40Q6PCS8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zbtb40Q6PCS8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zbtb40Q6PCS8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zbtb40Q6PCS8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zbtb40Q6PCS8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zbtb40Q6PCS8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Zbtb40Q6PCS8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zbtb40Q6PCS8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zbtb40Q6PCS8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zbtb40Q6PCS8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zbtb40Q6PCS8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zbtb40Q6PCS8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zbtb40Q6PCS8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Zbtb40Q6PCS8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zbtb40Q6PCS8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zbtb40Q6PCS8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
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