Protein–RNA interactions for Protein: Q6K1E7

Ggnbp1, Gametogenetin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp1Q6K1E7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ggnbp1Q6K1E7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1924.1 ms