Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atg9aQ68FE2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atg9aQ68FE2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atg9aQ68FE2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atg9aQ68FE2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atg9aQ68FE2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atg9aQ68FE2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atg9aQ68FE2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atg9aQ68FE2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Atg9aQ68FE2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atg9aQ68FE2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Atg9aQ68FE2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atg9aQ68FE2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atg9aQ68FE2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atg9aQ68FE2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atg9aQ68FE2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atg9aQ68FE2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atg9aQ68FE2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atg9aQ68FE2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atg9aQ68FE2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atg9aQ68FE2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atg9aQ68FE2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atg9aQ68FE2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Atg9aQ68FE2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Atg9aQ68FE2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atg9aQ68FE2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Atg9aQ68FE2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Atg9aQ68FE2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Atg9aQ68FE2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Atg9aQ68FE2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Atg9aQ68FE2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg9aQ68FE2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg9aQ68FE2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg9aQ68FE2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg9aQ68FE2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg9aQ68FE2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg9aQ68FE2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg9aQ68FE2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg9aQ68FE2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg9aQ68FE2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg9aQ68FE2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg9aQ68FE2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg9aQ68FE2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atg9aQ68FE2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atg9aQ68FE2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atg9aQ68FE2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atg9aQ68FE2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atg9aQ68FE2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atg9aQ68FE2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atg9aQ68FE2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atg9aQ68FE2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atg9aQ68FE2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atg9aQ68FE2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atg9aQ68FE2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atg9aQ68FE2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atg9aQ68FE2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atg9aQ68FE2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atg9aQ68FE2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atg9aQ68FE2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atg9aQ68FE2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atg9aQ68FE2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atg9aQ68FE2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atg9aQ68FE2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atg9aQ68FE2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atg9aQ68FE2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atg9aQ68FE2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atg9aQ68FE2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atg9aQ68FE2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atg9aQ68FE2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atg9aQ68FE2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atg9aQ68FE2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atg9aQ68FE2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atg9aQ68FE2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg9aQ68FE2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg9aQ68FE2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg9aQ68FE2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg9aQ68FE2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg9aQ68FE2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg9aQ68FE2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg9aQ68FE2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg9aQ68FE2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg9aQ68FE2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atg9aQ68FE2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atg9aQ68FE2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atg9aQ68FE2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atg9aQ68FE2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atg9aQ68FE2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Atg9aQ68FE2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atg9aQ68FE2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atg9aQ68FE2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Atg9aQ68FE2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atg9aQ68FE2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atg9aQ68FE2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atg9aQ68FE2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atg9aQ68FE2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg9aQ68FE2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg9aQ68FE2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg9aQ68FE2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg9aQ68FE2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg9aQ68FE2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms