Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mdc1Q5PSV9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mdc1Q5PSV9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mdc1Q5PSV9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Mdc1Q5PSV9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mdc1Q5PSV9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mdc1Q5PSV9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mdc1Q5PSV9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mdc1Q5PSV9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mdc1Q5PSV9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mdc1Q5PSV9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mdc1Q5PSV9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mdc1Q5PSV9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mdc1Q5PSV9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Mdc1Q5PSV9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mdc1Q5PSV9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mdc1Q5PSV9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mdc1Q5PSV9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mdc1Q5PSV9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mdc1Q5PSV9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mdc1Q5PSV9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mdc1Q5PSV9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mdc1Q5PSV9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Mdc1Q5PSV9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mdc1Q5PSV9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mdc1Q5PSV9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mdc1Q5PSV9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mdc1Q5PSV9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mdc1Q5PSV9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Mdc1Q5PSV9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mdc1Q5PSV9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mdc1Q5PSV9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mdc1Q5PSV9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mdc1Q5PSV9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mdc1Q5PSV9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mdc1Q5PSV9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mdc1Q5PSV9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mdc1Q5PSV9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mdc1Q5PSV9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mdc1Q5PSV9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mdc1Q5PSV9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mdc1Q5PSV9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Mdc1Q5PSV9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mdc1Q5PSV9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mdc1Q5PSV9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mdc1Q5PSV9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mdc1Q5PSV9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mdc1Q5PSV9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mdc1Q5PSV9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mdc1Q5PSV9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mdc1Q5PSV9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mdc1Q5PSV9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mdc1Q5PSV9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mdc1Q5PSV9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Mdc1Q5PSV9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Mdc1Q5PSV9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Mdc1Q5PSV9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Mdc1Q5PSV9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Mdc1Q5PSV9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Mdc1Q5PSV9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Mdc1Q5PSV9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Mdc1Q5PSV9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Mdc1Q5PSV9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Mdc1Q5PSV9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mdc1Q5PSV9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mdc1Q5PSV9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mdc1Q5PSV9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mdc1Q5PSV9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mdc1Q5PSV9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mdc1Q5PSV9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mdc1Q5PSV9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mdc1Q5PSV9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mdc1Q5PSV9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mdc1Q5PSV9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mdc1Q5PSV9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mdc1Q5PSV9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Mdc1Q5PSV9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mdc1Q5PSV9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mdc1Q5PSV9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mdc1Q5PSV9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mdc1Q5PSV9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mdc1Q5PSV9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mdc1Q5PSV9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mdc1Q5PSV9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mdc1Q5PSV9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mdc1Q5PSV9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mdc1Q5PSV9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mdc1Q5PSV9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mdc1Q5PSV9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mdc1Q5PSV9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mdc1Q5PSV9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mdc1Q5PSV9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Mdc1Q5PSV9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mdc1Q5PSV9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mdc1Q5PSV9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mdc1Q5PSV9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mdc1Q5PSV9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mdc1Q5PSV9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mdc1Q5PSV9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Mdc1Q5PSV9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms