Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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