Protein–RNA interactions for Protein: Q52KB6

C2cd3, C2 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2cd3Q52KB6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2cd3Q52KB6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2cd3Q52KB6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2cd3Q52KB6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2cd3Q52KB6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2cd3Q52KB6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2cd3Q52KB6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C2cd3Q52KB6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C2cd3Q52KB6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2cd3Q52KB6 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2cd3Q52KB6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2cd3Q52KB6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2cd3Q52KB6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2cd3Q52KB6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2cd3Q52KB6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2cd3Q52KB6 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2cd3Q52KB6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2cd3Q52KB6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2cd3Q52KB6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2cd3Q52KB6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2cd3Q52KB6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2cd3Q52KB6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2cd3Q52KB6 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C2cd3Q52KB6 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C2cd3Q52KB6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2cd3Q52KB6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2cd3Q52KB6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2cd3Q52KB6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2cd3Q52KB6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C2cd3Q52KB6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C2cd3Q52KB6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C2cd3Q52KB6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C2cd3Q52KB6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C2cd3Q52KB6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C2cd3Q52KB6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C2cd3Q52KB6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C2cd3Q52KB6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C2cd3Q52KB6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C2cd3Q52KB6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C2cd3Q52KB6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C2cd3Q52KB6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C2cd3Q52KB6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C2cd3Q52KB6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C2cd3Q52KB6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C2cd3Q52KB6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C2cd3Q52KB6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C2cd3Q52KB6 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C2cd3Q52KB6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C2cd3Q52KB6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C2cd3Q52KB6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C2cd3Q52KB6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C2cd3Q52KB6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C2cd3Q52KB6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C2cd3Q52KB6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C2cd3Q52KB6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C2cd3Q52KB6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C2cd3Q52KB6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C2cd3Q52KB6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C2cd3Q52KB6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C2cd3Q52KB6 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C2cd3Q52KB6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C2cd3Q52KB6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C2cd3Q52KB6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C2cd3Q52KB6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C2cd3Q52KB6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C2cd3Q52KB6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C2cd3Q52KB6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C2cd3Q52KB6 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C2cd3Q52KB6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C2cd3Q52KB6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C2cd3Q52KB6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C2cd3Q52KB6 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C2cd3Q52KB6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C2cd3Q52KB6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C2cd3Q52KB6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C2cd3Q52KB6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C2cd3Q52KB6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C2cd3Q52KB6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C2cd3Q52KB6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C2cd3Q52KB6 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C2cd3Q52KB6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C2cd3Q52KB6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C2cd3Q52KB6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C2cd3Q52KB6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C2cd3Q52KB6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C2cd3Q52KB6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C2cd3Q52KB6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C2cd3Q52KB6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C2cd3Q52KB6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C2cd3Q52KB6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C2cd3Q52KB6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C2cd3Q52KB6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C2cd3Q52KB6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C2cd3Q52KB6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C2cd3Q52KB6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C2cd3Q52KB6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C2cd3Q52KB6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C2cd3Q52KB6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C2cd3Q52KB6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C2cd3Q52KB6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms