Protein–RNA interactions for Protein: Q3USH5

Sfswap, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfswapQ3USH5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SfswapQ3USH5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SfswapQ3USH5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SfswapQ3USH5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SfswapQ3USH5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SfswapQ3USH5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SfswapQ3USH5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SfswapQ3USH5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SfswapQ3USH5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SfswapQ3USH5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SfswapQ3USH5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SfswapQ3USH5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SfswapQ3USH5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SfswapQ3USH5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SfswapQ3USH5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SfswapQ3USH5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SfswapQ3USH5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SfswapQ3USH5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SfswapQ3USH5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SfswapQ3USH5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SfswapQ3USH5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SfswapQ3USH5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SfswapQ3USH5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SfswapQ3USH5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SfswapQ3USH5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SfswapQ3USH5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SfswapQ3USH5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SfswapQ3USH5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SfswapQ3USH5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SfswapQ3USH5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SfswapQ3USH5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SfswapQ3USH5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SfswapQ3USH5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SfswapQ3USH5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SfswapQ3USH5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SfswapQ3USH5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SfswapQ3USH5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SfswapQ3USH5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SfswapQ3USH5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SfswapQ3USH5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SfswapQ3USH5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SfswapQ3USH5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SfswapQ3USH5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SfswapQ3USH5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SfswapQ3USH5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SfswapQ3USH5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SfswapQ3USH5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SfswapQ3USH5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SfswapQ3USH5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SfswapQ3USH5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SfswapQ3USH5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SfswapQ3USH5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SfswapQ3USH5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SfswapQ3USH5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SfswapQ3USH5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SfswapQ3USH5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SfswapQ3USH5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SfswapQ3USH5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SfswapQ3USH5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SfswapQ3USH5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SfswapQ3USH5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SfswapQ3USH5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SfswapQ3USH5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SfswapQ3USH5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SfswapQ3USH5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SfswapQ3USH5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SfswapQ3USH5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SfswapQ3USH5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SfswapQ3USH5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SfswapQ3USH5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SfswapQ3USH5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SfswapQ3USH5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SfswapQ3USH5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SfswapQ3USH5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SfswapQ3USH5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SfswapQ3USH5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SfswapQ3USH5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SfswapQ3USH5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SfswapQ3USH5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SfswapQ3USH5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SfswapQ3USH5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SfswapQ3USH5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SfswapQ3USH5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SfswapQ3USH5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SfswapQ3USH5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SfswapQ3USH5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SfswapQ3USH5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SfswapQ3USH5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SfswapQ3USH5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SfswapQ3USH5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SfswapQ3USH5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SfswapQ3USH5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SfswapQ3USH5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SfswapQ3USH5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SfswapQ3USH5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SfswapQ3USH5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SfswapQ3USH5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SfswapQ3USH5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SfswapQ3USH5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SfswapQ3USH5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.7 ms