Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULM6

Uspl1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uspl1Q3ULM6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Uspl1Q3ULM6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Uspl1Q3ULM6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Uspl1Q3ULM6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Uspl1Q3ULM6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Uspl1Q3ULM6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Uspl1Q3ULM6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Uspl1Q3ULM6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Uspl1Q3ULM6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Uspl1Q3ULM6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Uspl1Q3ULM6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Uspl1Q3ULM6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Uspl1Q3ULM6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Uspl1Q3ULM6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Uspl1Q3ULM6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Uspl1Q3ULM6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Uspl1Q3ULM6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Uspl1Q3ULM6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Uspl1Q3ULM6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Uspl1Q3ULM6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Uspl1Q3ULM6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Uspl1Q3ULM6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Uspl1Q3ULM6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Uspl1Q3ULM6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Uspl1Q3ULM6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Uspl1Q3ULM6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Uspl1Q3ULM6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Uspl1Q3ULM6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Uspl1Q3ULM6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Uspl1Q3ULM6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Uspl1Q3ULM6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Uspl1Q3ULM6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Uspl1Q3ULM6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Uspl1Q3ULM6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Uspl1Q3ULM6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Uspl1Q3ULM6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Uspl1Q3ULM6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Uspl1Q3ULM6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Uspl1Q3ULM6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Uspl1Q3ULM6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Uspl1Q3ULM6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Uspl1Q3ULM6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Uspl1Q3ULM6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Uspl1Q3ULM6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Uspl1Q3ULM6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Uspl1Q3ULM6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Uspl1Q3ULM6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Uspl1Q3ULM6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Uspl1Q3ULM6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Uspl1Q3ULM6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Uspl1Q3ULM6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Uspl1Q3ULM6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Uspl1Q3ULM6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Uspl1Q3ULM6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Uspl1Q3ULM6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Uspl1Q3ULM6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Uspl1Q3ULM6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Uspl1Q3ULM6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Uspl1Q3ULM6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Uspl1Q3ULM6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Uspl1Q3ULM6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Uspl1Q3ULM6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Uspl1Q3ULM6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Uspl1Q3ULM6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Uspl1Q3ULM6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Uspl1Q3ULM6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Uspl1Q3ULM6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Uspl1Q3ULM6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Uspl1Q3ULM6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Uspl1Q3ULM6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Uspl1Q3ULM6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Uspl1Q3ULM6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Uspl1Q3ULM6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Uspl1Q3ULM6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Uspl1Q3ULM6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Uspl1Q3ULM6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Uspl1Q3ULM6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Uspl1Q3ULM6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Uspl1Q3ULM6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Uspl1Q3ULM6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Uspl1Q3ULM6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Uspl1Q3ULM6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Uspl1Q3ULM6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Uspl1Q3ULM6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Uspl1Q3ULM6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Uspl1Q3ULM6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Uspl1Q3ULM6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Uspl1Q3ULM6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Uspl1Q3ULM6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Uspl1Q3ULM6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Uspl1Q3ULM6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Uspl1Q3ULM6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Uspl1Q3ULM6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Uspl1Q3ULM6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Uspl1Q3ULM6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Uspl1Q3ULM6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Uspl1Q3ULM6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Uspl1Q3ULM6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Uspl1Q3ULM6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Uspl1Q3ULM6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms