Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms