Protein–RNA interactions for Protein: Q38HM4

Trim63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim63Q38HM4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim63Q38HM4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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