Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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