Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIGQ13278 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIGQ13278 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIGQ13278 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIGQ13278 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIGQ13278 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIGQ13278 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIGQ13278 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIGQ13278 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIGQ13278 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIGQ13278 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIGQ13278 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIGQ13278 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIGQ13278 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIGQ13278 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIGQ13278 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIGQ13278 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIGQ13278 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIGQ13278 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIGQ13278 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIGQ13278 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIGQ13278 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIGQ13278 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIGQ13278 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIGQ13278 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIGQ13278 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIGQ13278 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIGQ13278 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIGQ13278 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIGQ13278 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIGQ13278 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIGQ13278 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIGQ13278 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIGQ13278 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIGQ13278 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIGQ13278 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIGQ13278 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIGQ13278 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIGQ13278 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIGQ13278 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIGQ13278 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIGQ13278 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIGQ13278 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIGQ13278 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RIGQ13278 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIGQ13278 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIGQ13278 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIGQ13278 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIGQ13278 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIGQ13278 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIGQ13278 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIGQ13278 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIGQ13278 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIGQ13278 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIGQ13278 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIGQ13278 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIGQ13278 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIGQ13278 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RIGQ13278 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIGQ13278 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIGQ13278 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RIGQ13278 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
RIGQ13278 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RIGQ13278 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RIGQ13278 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
RIGQ13278 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RIGQ13278 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RIGQ13278 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RIGQ13278 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RIGQ13278 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RIGQ13278 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RIGQ13278 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RIGQ13278 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIGQ13278 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIGQ13278 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIGQ13278 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIGQ13278 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIGQ13278 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIGQ13278 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIGQ13278 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIGQ13278 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIGQ13278 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIGQ13278 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIGQ13278 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIGQ13278 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIGQ13278 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIGQ13278 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIGQ13278 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIGQ13278 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIGQ13278 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIGQ13278 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIGQ13278 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIGQ13278 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIGQ13278 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIGQ13278 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIGQ13278 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIGQ13278 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIGQ13278 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIGQ13278 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIGQ13278 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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