Protein–RNA interactions for Protein: Q12380

ATG5, Autophagy protein 5, yeastyeast

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG5Q12380 YLR163W-AYLR163W-A 114 nt2.59□□□□□ -1.99
ATG5Q12380 COQ9YLR201C 783 nt2.59□□□□□ -1.99
ATG5Q12380 OST6YML019W 999 nt2.59□□□□□ -1.99
ATG5Q12380 MCT1YOR221C 1083 nt2.59□□□□□ -1.99
ATG5Q12380 CSH1YBR161W 1131 nt2.59□□□□□ -1.99
ATG5Q12380 STP2YHR006W 1626 nt2.59□□□□□ -1.99
ATG5Q12380 YNR066CYNR066C 1311 nt2.59□□□□□ -2
ATG5Q12380 MTL1YGR023W 1656 nt2.59□□□□□ -2
ATG5Q12380 GCD6YDR211W 2139 nt2.59□□□□□ -2
ATG5Q12380 ATG13YPR185W 2217 nt2.58□□□□□ -2
ATG5Q12380 SRB8YCR081W 4284 nt2.58□□□□□ -2
ATG5Q12380 YDR131CYDR131C 1671 nt2.58□□□□□ -2
ATG5Q12380 RPS14AYCR031C 414 nt2.58□□□□□ -2
ATG5Q12380 HTA1YDR225W 399 nt2.58□□□□□ -2
ATG5Q12380 RPL1BYGL135W 654 nt2.58□□□□□ -2
ATG5Q12380 YHR097CYHR097C 1101 nt2.58□□□□□ -2
ATG5Q12380 IME1YJR094C 1083 nt2.58□□□□□ -2
ATG5Q12380 MET14YKL001C 609 nt2.58□□□□□ -2
ATG5Q12380 RPL13BYMR142C 600 nt2.58□□□□□ -2
ATG5Q12380 PNO1YOR145C 825 nt2.58□□□□□ -2
ATG5Q12380 RPL1AYPL220W 654 nt2.58□□□□□ -2
ATG5Q12380 DIM1YPL266W 957 nt2.58□□□□□ -2
ATG5Q12380 ICS2YBR157C 768 nt2.58□□□□□ -2
ATG5Q12380 YBR292CYBR292C 372 nt2.58□□□□□ -2
ATG5Q12380 YTA7YGR270W 4140 nt2.58□□□□□ -2
ATG5Q12380 ITT1YML068W 1395 nt2.58□□□□□ -2
ATG5Q12380 FLO5YHR211W 3228 nt2.58□□□□□ -2
ATG5Q12380 RAX2YLR084C 3663 nt2.57□□□□□ -2
ATG5Q12380 ESL1YIL151C 3357 nt2.57□□□□□ -2
ATG5Q12380 AKR1YDR264C 2295 nt2.57□□□□□ -2
ATG5Q12380 BSC1YDL037C 987 nt2.57□□□□□ -2
ATG5Q12380 PEX10YDR265W 1014 nt2.57□□□□□ -2
ATG5Q12380 SMT3YDR510W 306 nt2.57□□□□□ -2
ATG5Q12380 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt2.57□□□□□ -2
ATG5Q12380 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt2.57□□□□□ -2
ATG5Q12380 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt2.57□□□□□ -2
ATG5Q12380 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt2.57□□□□□ -2
ATG5Q12380 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt2.57□□□□□ -2
ATG5Q12380 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt2.57□□□□□ -2
ATG5Q12380 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt2.57□□□□□ -2
ATG5Q12380 YGL214WYGL214W 486 nt2.57□□□□□ -2
ATG5Q12380 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt2.57□□□□□ -2
ATG5Q12380 SWD2YKL018W 990 nt2.57□□□□□ -2
ATG5Q12380 SFH1YLR321C 1281 nt2.57□□□□□ -2
ATG5Q12380 IRC13YOR235W 315 nt2.57□□□□□ -2
ATG5Q12380 YPR053CYPR053C 456 nt2.57□□□□□ -2
ATG5Q12380 CDC5YMR001C 2118 nt2.57□□□□□ -2
ATG5Q12380 TEC1YBR083W 1461 nt2.57□□□□□ -2
ATG5Q12380 EXO70YJL085W 1872 nt2.56□□□□□ -2
ATG5Q12380 OPI6YDL096C 327 nt2.56□□□□□ -2
ATG5Q12380 PET100YDR079W 336 nt2.56□□□□□ -2
ATG5Q12380 PLP1YDR183W 693 nt2.56□□□□□ -2
ATG5Q12380 YEL075CYEL075C 369 nt2.56□□□□□ -2
ATG5Q12380 PNC1YGL037C 651 nt2.56□□□□□ -2
ATG5Q12380 YGL177WYGL177W 348 nt2.56□□□□□ -2
ATG5Q12380 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.56□□□□□ -2
ATG5Q12380 YHR214C-DYHR214C-D 294 nt2.56□□□□□ -2
ATG5Q12380 RPS21BYJL136C 264 nt2.56□□□□□ -2
ATG5Q12380 CPR7YJR032W 1182 nt2.56□□□□□ -2
ATG5Q12380 YAR069CYAR069C 294 nt2.56□□□□□ -2
ATG5Q12380 GSP1YLR293C 660 nt2.56□□□□□ -2
ATG5Q12380 SSU72YNL222W 621 nt2.56□□□□□ -2
ATG5Q12380 RPA43YOR340C 981 nt2.56□□□□□ -2
ATG5Q12380 NDC80YIL144W 2076 nt2.56□□□□□ -2
ATG5Q12380 PSP1YDR505C 2526 nt2.56□□□□□ -2
ATG5Q12380 TFC4YGR047C 3078 nt2.55□□□□□ -2
ATG5Q12380 FLO1YAR050W 4614 nt2.55□□□□□ -2
ATG5Q12380 YCR016WYCR016W 873 nt2.55□□□□□ -2
ATG5Q12380 KIN82YCR091W 2163 nt2.55□□□□□ -2
ATG5Q12380 ECM11YDR446W 909 nt2.55□□□□□ -2
ATG5Q12380 FMP32YFL046W 624 nt2.55□□□□□ -2
ATG5Q12380 PMR1YGL167C 2853 nt2.55□□□□□ -2
ATG5Q12380 YGR039WYGR039W 312 nt2.55□□□□□ -2
ATG5Q12380 RPS23AYGR118W 438 nt2.55□□□□□ -2
ATG5Q12380 CHO2YGR157W 2610 nt2.55□□□□□ -2
ATG5Q12380 TIF4631YGR162W 2859 nt2.55□□□□□ -2
ATG5Q12380 TDA10YGR205W 873 nt2.55□□□□□ -2
ATG5Q12380 RGI2YIL057C 495 nt2.55□□□□□ -2
ATG5Q12380 DAL2YIR029W 1032 nt2.55□□□□□ -2
ATG5Q12380 AIM26YKL037W 357 nt2.55□□□□□ -2
ATG5Q12380 PML39YML107C 1005 nt2.55□□□□□ -2
ATG5Q12380 YBL028CYBL028C 321 nt2.55□□□□□ -2
ATG5Q12380 FYV6YNL133C 522 nt2.55□□□□□ -2
ATG5Q12380 RPS23BYPR132W 438 nt2.55□□□□□ -2
ATG5Q12380 ERV15YBR210W 429 nt2.55□□□□□ -2
ATG5Q12380 CTP1YBR291C 900 nt2.55□□□□□ -2
ATG5Q12380 VBA4YDR119W 2307 nt2.54□□□□□ -2
ATG5Q12380 ERG11YHR007C 1593 nt2.54□□□□□ -2
ATG5Q12380 DUN1YDL101C 1542 nt2.54□□□□□ -2
ATG5Q12380 PSY4YBL046W 1326 nt2.54□□□□□ -2
ATG5Q12380 APA2YDR530C 978 nt2.54□□□□□ -2
ATG5Q12380 QCR10YHR001W-A 234 nt2.54□□□□□ -2
ATG5Q12380 YHR022CYHR022C 771 nt2.54□□□□□ -2
ATG5Q12380 ALB1YJL122W 528 nt2.54□□□□□ -2
ATG5Q12380 HYM1YKL189W 1200 nt2.54□□□□□ -2
ATG5Q12380 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt2.54□□□□□ -2
ATG5Q12380 RNH203YLR154C 333 nt2.54□□□□□ -2
ATG5Q12380 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt2.54□□□□□ -2
ATG5Q12380 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt2.54□□□□□ -2
ATG5Q12380 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 45.3 ms