Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gdf9Q07105 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gdf9Q07105 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gdf9Q07105 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gdf9Q07105 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gdf9Q07105 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gdf9Q07105 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gdf9Q07105 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gdf9Q07105 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gdf9Q07105 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gdf9Q07105 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gdf9Q07105 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gdf9Q07105 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gdf9Q07105 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gdf9Q07105 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gdf9Q07105 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gdf9Q07105 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gdf9Q07105 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gdf9Q07105 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gdf9Q07105 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gdf9Q07105 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gdf9Q07105 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gdf9Q07105 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gdf9Q07105 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gdf9Q07105 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gdf9Q07105 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gdf9Q07105 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gdf9Q07105 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms