Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms