Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bop1P97452 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bop1P97452 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bop1P97452 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bop1P97452 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bop1P97452 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bop1P97452 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bop1P97452 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bop1P97452 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bop1P97452 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms