Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GTF2IP78347 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF2IP78347 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF2IP78347 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF2IP78347 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF2IP78347 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF2IP78347 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF2IP78347 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF2IP78347 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF2IP78347 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF2IP78347 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF2IP78347 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF2IP78347 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF2IP78347 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF2IP78347 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF2IP78347 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF2IP78347 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF2IP78347 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF2IP78347 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF2IP78347 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF2IP78347 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2IP78347 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2IP78347 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2IP78347 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2IP78347 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2IP78347 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2IP78347 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2IP78347 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2IP78347 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2IP78347 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2IP78347 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2IP78347 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2IP78347 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2IP78347 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2IP78347 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2IP78347 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2IP78347 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2IP78347 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2IP78347 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2IP78347 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2IP78347 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF2IP78347 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF2IP78347 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF2IP78347 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF2IP78347 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF2IP78347 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF2IP78347 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF2IP78347 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF2IP78347 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF2IP78347 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF2IP78347 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF2IP78347 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF2IP78347 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF2IP78347 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF2IP78347 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF2IP78347 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms