Protein–RNA interactions for Protein: P56386

Defb1, Beta-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 69 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb1P56386 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defb1P56386 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defb1P56386 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defb1P56386 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defb1P56386 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defb1P56386 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defb1P56386 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defb1P56386 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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