Protein–RNA interactions for Protein: P47934

Crat, Carnitine O-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CratP47934 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CratP47934 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CratP47934 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CratP47934 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CratP47934 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CratP47934 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CratP47934 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CratP47934 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CratP47934 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CratP47934 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CratP47934 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CratP47934 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CratP47934 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CratP47934 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CratP47934 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CratP47934 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CratP47934 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CratP47934 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CratP47934 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CratP47934 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CratP47934 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CratP47934 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CratP47934 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CratP47934 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CratP47934 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CratP47934 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CratP47934 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CratP47934 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CratP47934 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CratP47934 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CratP47934 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CratP47934 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CratP47934 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CratP47934 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CratP47934 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CratP47934 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CratP47934 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CratP47934 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CratP47934 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CratP47934 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CratP47934 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CratP47934 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CratP47934 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CratP47934 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CratP47934 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CratP47934 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CratP47934 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CratP47934 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CratP47934 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CratP47934 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CratP47934 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CratP47934 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CratP47934 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CratP47934 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CratP47934 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CratP47934 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CratP47934 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CratP47934 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CratP47934 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CratP47934 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CratP47934 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CratP47934 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CratP47934 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CratP47934 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CratP47934 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CratP47934 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CratP47934 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CratP47934 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CratP47934 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CratP47934 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CratP47934 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CratP47934 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CratP47934 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CratP47934 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CratP47934 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CratP47934 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CratP47934 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CratP47934 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CratP47934 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CratP47934 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CratP47934 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CratP47934 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CratP47934 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CratP47934 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CratP47934 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CratP47934 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CratP47934 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CratP47934 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CratP47934 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CratP47934 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CratP47934 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CratP47934 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CratP47934 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CratP47934 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CratP47934 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CratP47934 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CratP47934 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CratP47934 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CratP47934 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CratP47934 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms