Protein–RNA interactions for Protein: P36405

ARL3, ADP-ribosylation factor-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL3P36405 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARL3P36405 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARL3P36405 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARL3P36405 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARL3P36405 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARL3P36405 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARL3P36405 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARL3P36405 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ARL3P36405 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARL3P36405 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ARL3P36405 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARL3P36405 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARL3P36405 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARL3P36405 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARL3P36405 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARL3P36405 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARL3P36405 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARL3P36405 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ARL3P36405 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARL3P36405 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARL3P36405 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ARL3P36405 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARL3P36405 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARL3P36405 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARL3P36405 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARL3P36405 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARL3P36405 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARL3P36405 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARL3P36405 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARL3P36405 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARL3P36405 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARL3P36405 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARL3P36405 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ARL3P36405 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARL3P36405 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARL3P36405 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARL3P36405 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ARL3P36405 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARL3P36405 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARL3P36405 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARL3P36405 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARL3P36405 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARL3P36405 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARL3P36405 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARL3P36405 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARL3P36405 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARL3P36405 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARL3P36405 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARL3P36405 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARL3P36405 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARL3P36405 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARL3P36405 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ARL3P36405 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ARL3P36405 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ARL3P36405 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARL3P36405 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARL3P36405 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARL3P36405 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARL3P36405 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARL3P36405 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARL3P36405 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARL3P36405 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ARL3P36405 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARL3P36405 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARL3P36405 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARL3P36405 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARL3P36405 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARL3P36405 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARL3P36405 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARL3P36405 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARL3P36405 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARL3P36405 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARL3P36405 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARL3P36405 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARL3P36405 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARL3P36405 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARL3P36405 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ARL3P36405 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARL3P36405 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARL3P36405 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARL3P36405 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARL3P36405 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARL3P36405 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARL3P36405 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARL3P36405 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARL3P36405 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARL3P36405 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARL3P36405 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARL3P36405 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARL3P36405 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARL3P36405 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ARL3P36405 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARL3P36405 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARL3P36405 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARL3P36405 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARL3P36405 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARL3P36405 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ARL3P36405 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARL3P36405 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARL3P36405 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms