Protein–RNA interactions for Protein: P30549

Tacr2, Substance-K receptor, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr2P30549 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tacr2P30549 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tacr2P30549 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tacr2P30549 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tacr2P30549 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tacr2P30549 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tacr2P30549 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms