Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kif3aP28741 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.9 ms