Protein–RNA interactions for Protein: P26368

U2AF2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF2P26368 CDYL-208ENST00000483019 773 ntTSL 210.48□□□□□ -0.731e-6■■■■■ 27.2
U2AF2P26368 CDYL-204ENST00000440139 690 ntTSL 38.97□□□□□ -0.971e-6■■■■■ 27.2
U2AF2P26368 CDYL-209ENST00000491864 614 ntTSL 57.58□□□□□ -1.21e-6■■■■■ 27.2
U2AF2P26368 MYB-240ENST00000534736 801 ntTSL 1 (best)4.61□□□□□ -1.672e-13■■■■■ 27.1
U2AF2P26368 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.859e-7■■■■■ 27.1
U2AF2P26368 COQ6-215ENST00000556300 1244 ntTSL 1 (best)19.89■□□□□ 0.779e-7■■■■■ 27.1
U2AF2P26368 COQ6-217ENST00000557205 1242 ntTSL 219.37■□□□□ 0.699e-7■■■■■ 27.1
U2AF2P26368 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.679e-7■■■■■ 27.1
U2AF2P26368 COQ6-218ENST00000557584 1013 ntTSL 218.03■□□□□ 0.489e-7■■■■■ 27.1
U2AF2P26368 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.359e-7■■■■■ 27.1
U2AF2P26368 COQ6-209ENST00000554341 1486 ntTSL 1 (best)15.62■□□□□ 0.099e-7■■■■■ 27.1
U2AF2P26368 COQ6-202ENST00000394026 1608 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.279e-7■■■■■ 27.1
U2AF2P26368 COQ6-208ENST00000554320 864 ntTSL 510.62□□□□□ -0.719e-7■■■■■ 27.1
U2AF2P26368 COQ6-213ENST00000555511 1132 ntTSL 210.61□□□□□ -0.719e-7■■■■■ 27.1
U2AF2P26368 COQ6-204ENST00000553462 1455 ntTSL 510.42□□□□□ -0.749e-7■■■■■ 27.1
U2AF2P26368 QKI-208ENST00000537041 583 ntTSL 510.41□□□□□ -0.743e-8■■■■■ 27.1
U2AF2P26368 QKI-211ENST00000540719 588 ntTSL 29.76□□□□□ -0.853e-8■■■■■ 27.1
U2AF2P26368 QKI-206ENST00000424802 954 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.263e-8■■■■■ 27.1
U2AF2P26368 QKI-215ENST00000544823 597 ntTSL 22.81□□□□□ -1.963e-8■■■■■ 27.1
U2AF2P26368 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.831e-6■■■■■ 27.1
U2AF2P26368 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.711e-6■■■■■ 27.1
U2AF2P26368 ZFP91-CNTF-202ENST00000422974 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 513.28□□□□□ -0.281e-6■■■■■ 27.1
U2AF2P26368 CDON-208ENST00000534661 1948 ntTSL 512.45□□□□□ -0.423e-8■■■■■ 27.1
U2AF2P26368 TNPO3-203ENST00000471234 3283 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.777e-7■■■■■ 27.1
U2AF2P26368 TNPO3-202ENST00000471166 3019 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.787e-7■■■■■ 27.1
U2AF2P26368 GINS1-201ENST00000262460 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.791e-6■■■■■ 27.1
U2AF2P26368 TNPO3-205ENST00000627585 4514 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.817e-7■■■■■ 27.1
U2AF2P26368 TNPO3-204ENST00000482320 3585 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.837e-7■■■■■ 27.1
U2AF2P26368 TNPO3-201ENST00000265388 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.867e-7■■■■■ 27.1
U2AF2P26368 UBR4-207ENST00000425413 2954 ntTSL 213.34□□□□□ -0.271e-6■■■■■ 27.1
U2AF2P26368 TP53BP1-210ENST00000450115 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.636e-9■■■■■ 27.1
U2AF2P26368 TP53BP1-216ENST00000572085 5574 ntTSL 210.37□□□□□ -0.756e-9■■■■■ 27.1
U2AF2P26368 TP53BP1-201ENST00000263801 6346 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.876e-9■■■■■ 27.1
U2AF2P26368 TP53BP1-203ENST00000382044 10384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.926e-9■■■■■ 27.1
U2AF2P26368 TP53BP1-202ENST00000382039 6015 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -16e-9■■■■■ 27.1
U2AF2P26368 CHD8-210ENST00000555962 1232 ntTSL 510.17□□□□□ -0.781e-7■■■■■ 27.1
U2AF2P26368 GTPBP2-210ENST00000496137 516 ntTSL 37.84□□□□□ -1.151e-7■■■■■ 27.1
U2AF2P26368 SYNJ2-206ENST00000485863 810 ntTSL 320.38■□□□□ 0.854e-7■■■■■ 27.1
U2AF2P26368 HERC1-214ENST00000561400 2215 ntTSL 213.25□□□□□ -0.297e-7■■■■■ 27
U2AF2P26368 AC243919.1-201ENST00000613086 785 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.142e-6■■■■■ 27
U2AF2P26368 UBE2Q2P2-201ENST00000558542 387 ntTSL 53.06□□□□□ -1.922e-6■■■■■ 27
U2AF2P26368 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.414e-9■■■■■ 27
U2AF2P26368 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.114e-9■■■■■ 27
U2AF2P26368 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.044e-9■■■■■ 27
U2AF2P26368 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.844e-9■■■■■ 27
U2AF2P26368 C20orf194-202ENST00000619760 2151 ntTSL 217.33■□□□□ 0.363e-6■■■■■ 27
U2AF2P26368 HSP90AB1-203ENST00000371646 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.482e-12■■■■■ 27
U2AF2P26368 HSP90AB1-202ENST00000371554 2674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.542e-12■■■■■ 27
U2AF2P26368 HSP90AB1-201ENST00000353801 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.712e-12■■■■■ 27
U2AF2P26368 HSP90AB1-204ENST00000620073 2644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.742e-12■■■■■ 27
U2AF2P26368 MTFMT-206ENST00000560717 1111 ntTSL 522.57■■□□□ 1.24e-6■■■■■ 27
U2AF2P26368 MTFMT-203ENST00000558460 1522 ntTSL 522.46■■□□□ 1.194e-6■■■■■ 27
U2AF2P26368 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.464e-6■■■■■ 27
U2AF2P26368 CSDE1-211ENST00000525970 503 ntTSL 43.35□□□□□ -1.873e-6■■■■■ 27
U2AF2P26368 CSDE1-209ENST00000525132 521 ntTSL 53.26□□□□□ -1.893e-6■■■■■ 27
U2AF2P26368 CSDE1-210ENST00000525878 626 ntTSL 40.4□□□□□ -2.353e-6■■■■■ 27
U2AF2P26368 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.493e-6■■■■■ 27
U2AF2P26368 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.733e-6■■■■■ 27
U2AF2P26368 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.883e-6■■■■■ 27
U2AF2P26368 ECHDC1-206ENST00000417628 767 ntTSL 56.07□□□□□ -1.449e-7■■■■■ 27
U2AF2P26368 PUS1-209ENST00000543754 1378 ntTSL 212.18□□□□□ -0.462e-7■■■■■ 27
U2AF2P26368 UBR4-210ENST00000466969 510 ntTSL 213.99□□□□□ -0.175e-14■■■■■ 27
U2AF2P26368 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.563e-21■■■■■ 27
U2AF2P26368 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.333e-21■■■■■ 27
U2AF2P26368 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.983e-21■■■■■ 27
U2AF2P26368 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.663e-21■■■■■ 27
U2AF2P26368 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.613e-21■■■■■ 27
U2AF2P26368 EIF2B4-202ENST00000405940 1570 ntTSL 1 (best)18.14■□□□□ 0.493e-21■■■■■ 27
U2AF2P26368 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.463e-21■■■■■ 27
U2AF2P26368 EIF2B4-209ENST00000478311 607 ntTSL 212.94□□□□□ -0.343e-21■■■■■ 27
U2AF2P26368 METTL22-213ENST00000564624 260 ntTSL 1 (best)18.15■□□□□ 0.52e-8■■■■■ 27
U2AF2P26368 HNRNPU-212ENST00000638230 1922 ntTSL 514.64□□□□□ -0.076e-11■■■■■ 27
U2AF2P26368 PAPD7-203ENST00000511764 741 ntTSL 210.69□□□□□ -0.77e-8■■■■■ 27
U2AF2P26368 PDCD2-201ENST00000167218 1118 ntTSL 531.38■■■□□ 2.611e-6■■■■■ 27
U2AF2P26368 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.141e-6■■■■■ 27
U2AF2P26368 PDCD2-214ENST00000545869 900 ntTSL 526.81■■□□□ 1.881e-6■■■■■ 27
U2AF2P26368 USP6NL-204ENST00000606752 1823 ntTSL 1 (best)24.96■■□□□ 1.591e-6■■■■■ 27
U2AF2P26368 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.091e-6■■■■■ 27
U2AF2P26368 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.831e-6■■■■■ 27
U2AF2P26368 PDCD2-213ENST00000544866 710 ntTSL 519.05■□□□□ 0.641e-6■■■■■ 27
U2AF2P26368 LMBR1-215ENST00000461603 612 ntTSL 45.9□□□□□ -1.461e-6■■■■■ 27
U2AF2P26368 PDCD2-210ENST00000543284 3255 ntTSL 24.35□□□□□ -1.711e-6■■■■■ 27
U2AF2P26368 TP53BP1-205ENST00000413546 3143 ntTSL 59.06□□□□□ -0.964e-18■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 ZCCHC11-212ENST00000481133 521 ntTSL 31.72□□□□□ -2.132e-9■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.413e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.133e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.073e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.043e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.53e-7■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 POLR1C-207ENST00000481352 1725 ntTSL 517.55■□□□□ 0.43e-7■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.153e-7■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 POLR1C-206ENST00000455605 1882 ntTSL 514.72□□□□□ -0.053e-7■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 POLR1C-202ENST00000372344 1119 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.293e-7■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 POLR1C-208ENST00000488601 973 ntTSL 26.82□□□□□ -1.323e-7■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.931e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.871e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.841e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.831e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.361e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.271e-6■■■■■ 26.9
Retrieved 100 of 36,523 protein–RNA pairs in 592.3 ms