Protein–RNA interactions for Protein: P21246

PTN, Pleiotrophin, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTNP21246 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTNP21246 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTNP21246 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTNP21246 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTNP21246 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTNP21246 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTNP21246 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTNP21246 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTNP21246 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTNP21246 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTNP21246 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTNP21246 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PTNP21246 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTNP21246 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTNP21246 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTNP21246 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTNP21246 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTNP21246 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTNP21246 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTNP21246 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTNP21246 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTNP21246 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTNP21246 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTNP21246 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTNP21246 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTNP21246 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTNP21246 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PTNP21246 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTNP21246 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTNP21246 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PTNP21246 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTNP21246 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTNP21246 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTNP21246 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTNP21246 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTNP21246 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTNP21246 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTNP21246 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTNP21246 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTNP21246 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTNP21246 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTNP21246 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTNP21246 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PTNP21246 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTNP21246 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTNP21246 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTNP21246 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTNP21246 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PTNP21246 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTNP21246 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTNP21246 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTNP21246 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTNP21246 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTNP21246 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PTNP21246 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTNP21246 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTNP21246 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTNP21246 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTNP21246 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTNP21246 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTNP21246 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTNP21246 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTNP21246 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTNP21246 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTNP21246 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTNP21246 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTNP21246 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTNP21246 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTNP21246 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PTNP21246 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTNP21246 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTNP21246 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTNP21246 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTNP21246 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTNP21246 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTNP21246 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTNP21246 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTNP21246 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTNP21246 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTNP21246 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTNP21246 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTNP21246 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PTNP21246 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTNP21246 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PTNP21246 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTNP21246 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTNP21246 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTNP21246 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTNP21246 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTNP21246 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTNP21246 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTNP21246 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTNP21246 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTNP21246 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PTNP21246 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTNP21246 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTNP21246 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTNP21246 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTNP21246 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTNP21246 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms