Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lama1P19137 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lama1P19137 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lama1P19137 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lama1P19137 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lama1P19137 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lama1P19137 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lama1P19137 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lama1P19137 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Lama1P19137 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Lama1P19137 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Lama1P19137 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Lama1P19137 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lama1P19137 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lama1P19137 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lama1P19137 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lama1P19137 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lama1P19137 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lama1P19137 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lama1P19137 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Lama1P19137 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lama1P19137 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lama1P19137 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lama1P19137 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lama1P19137 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lama1P19137 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lama1P19137 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lama1P19137 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lama1P19137 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lama1P19137 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lama1P19137 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lama1P19137 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lama1P19137 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lama1P19137 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lama1P19137 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lama1P19137 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Lama1P19137 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lama1P19137 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lama1P19137 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lama1P19137 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lama1P19137 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lama1P19137 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lama1P19137 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Lama1P19137 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lama1P19137 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lama1P19137 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lama1P19137 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Lama1P19137 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lama1P19137 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lama1P19137 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lama1P19137 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lama1P19137 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lama1P19137 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lama1P19137 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lama1P19137 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lama1P19137 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lama1P19137 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lama1P19137 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lama1P19137 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lama1P19137 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lama1P19137 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lama1P19137 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lama1P19137 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lama1P19137 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lama1P19137 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lama1P19137 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lama1P19137 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lama1P19137 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lama1P19137 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lama1P19137 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lama1P19137 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lama1P19137 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lama1P19137 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lama1P19137 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lama1P19137 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lama1P19137 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lama1P19137 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lama1P19137 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lama1P19137 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lama1P19137 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lama1P19137 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lama1P19137 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms