Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spi1P17433 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spi1P17433 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spi1P17433 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spi1P17433 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spi1P17433 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spi1P17433 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spi1P17433 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms