Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Lamc1P02468 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Lamc1P02468 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Lamc1P02468 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Lamc1P02468 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Lamc1P02468 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Lamc1P02468 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Lamc1P02468 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Lamc1P02468 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Lamc1P02468 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Lamc1P02468 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Lamc1P02468 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Lamc1P02468 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Lamc1P02468 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Lamc1P02468 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Lamc1P02468 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Lamc1P02468 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Lamc1P02468 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Lamc1P02468 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Lamc1P02468 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Lamc1P02468 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Lamc1P02468 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lamc1P02468 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Lamc1P02468 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lamc1P02468 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lamc1P02468 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Lamc1P02468 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Lamc1P02468 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Lamc1P02468 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Lamc1P02468 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Lamc1P02468 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Lamc1P02468 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Lamc1P02468 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Lamc1P02468 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Lamc1P02468 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Lamc1P02468 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Lamc1P02468 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Lamc1P02468 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Lamc1P02468 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Lamc1P02468 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Lamc1P02468 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Lamc1P02468 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Lamc1P02468 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lamc1P02468 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lamc1P02468 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lamc1P02468 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lamc1P02468 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lamc1P02468 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lamc1P02468 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Lamc1P02468 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Lamc1P02468 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Lamc1P02468 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Lamc1P02468 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Lamc1P02468 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Lamc1P02468 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Lamc1P02468 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Lamc1P02468 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Lamc1P02468 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Lamc1P02468 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Lamc1P02468 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lamc1P02468 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lamc1P02468 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Lamc1P02468 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lamc1P02468 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lamc1P02468 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lamc1P02468 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lamc1P02468 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lamc1P02468 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lamc1P02468 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Lamc1P02468 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Lamc1P02468 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lamc1P02468 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lamc1P02468 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lamc1P02468 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lamc1P02468 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Lamc1P02468 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lamc1P02468 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Lamc1P02468 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lamc1P02468 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lamc1P02468 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lamc1P02468 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lamc1P02468 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lamc1P02468 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lamc1P02468 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lamc1P02468 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Lamc1P02468 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lamc1P02468 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lamc1P02468 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Lamc1P02468 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lamc1P02468 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lamc1P02468 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lamc1P02468 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Lamc1P02468 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lamc1P02468 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lamc1P02468 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lamc1P02468 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lamc1P02468 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lamc1P02468 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lamc1P02468 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lamc1P02468 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120 ms