Protein–RNA interactions for Protein: O88737

Bsn, Protein bassoon, mousemouse

Predictions only

Length 3,942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BsnO88737 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BsnO88737 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BsnO88737 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BsnO88737 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BsnO88737 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BsnO88737 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BsnO88737 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
BsnO88737 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BsnO88737 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BsnO88737 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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BsnO88737 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BsnO88737 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BsnO88737 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BsnO88737 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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BsnO88737 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BsnO88737 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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BsnO88737 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BsnO88737 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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BsnO88737 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BsnO88737 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BsnO88737 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BsnO88737 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BsnO88737 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BsnO88737 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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BsnO88737 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BsnO88737 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BsnO88737 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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BsnO88737 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BsnO88737 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BsnO88737 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BsnO88737 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BsnO88737 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BsnO88737 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BsnO88737 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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BsnO88737 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BsnO88737 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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BsnO88737 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BsnO88737 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BsnO88737 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BsnO88737 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BsnO88737 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BsnO88737 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BsnO88737 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BsnO88737 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BsnO88737 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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BsnO88737 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BsnO88737 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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BsnO88737 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BsnO88737 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BsnO88737 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BsnO88737 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BsnO88737 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BsnO88737 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BsnO88737 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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BsnO88737 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BsnO88737 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BsnO88737 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BsnO88737 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BsnO88737 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
BsnO88737 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BsnO88737 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BsnO88737 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BsnO88737 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BsnO88737 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BsnO88737 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BsnO88737 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BsnO88737 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BsnO88737 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BsnO88737 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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BsnO88737 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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