Protein–RNA interactions for Protein: O88516

Dll3, Delta-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dll3O88516 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dll3O88516 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dll3O88516 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dll3O88516 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dll3O88516 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Dll3O88516 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dll3O88516 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dll3O88516 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dll3O88516 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dll3O88516 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dll3O88516 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dll3O88516 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dll3O88516 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dll3O88516 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dll3O88516 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dll3O88516 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dll3O88516 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dll3O88516 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dll3O88516 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dll3O88516 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dll3O88516 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dll3O88516 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dll3O88516 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dll3O88516 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dll3O88516 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dll3O88516 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dll3O88516 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dll3O88516 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dll3O88516 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dll3O88516 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dll3O88516 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dll3O88516 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Dll3O88516 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dll3O88516 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Dll3O88516 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dll3O88516 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dll3O88516 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dll3O88516 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dll3O88516 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dll3O88516 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dll3O88516 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Dll3O88516 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Dll3O88516 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Dll3O88516 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dll3O88516 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Dll3O88516 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dll3O88516 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dll3O88516 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dll3O88516 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dll3O88516 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms