Protein–RNA interactions for Protein: O88343

Slc4a4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a4O88343 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc4a4O88343 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc4a4O88343 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc4a4O88343 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc4a4O88343 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc4a4O88343 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc4a4O88343 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc4a4O88343 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc4a4O88343 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc4a4O88343 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc4a4O88343 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc4a4O88343 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc4a4O88343 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc4a4O88343 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc4a4O88343 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc4a4O88343 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc4a4O88343 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc4a4O88343 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc4a4O88343 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc4a4O88343 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc4a4O88343 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc4a4O88343 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc4a4O88343 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc4a4O88343 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc4a4O88343 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc4a4O88343 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc4a4O88343 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc4a4O88343 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc4a4O88343 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc4a4O88343 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc4a4O88343 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc4a4O88343 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc4a4O88343 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc4a4O88343 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc4a4O88343 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc4a4O88343 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc4a4O88343 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc4a4O88343 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc4a4O88343 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc4a4O88343 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc4a4O88343 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc4a4O88343 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc4a4O88343 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc4a4O88343 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc4a4O88343 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc4a4O88343 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc4a4O88343 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc4a4O88343 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc4a4O88343 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc4a4O88343 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc4a4O88343 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc4a4O88343 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc4a4O88343 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc4a4O88343 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc4a4O88343 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc4a4O88343 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc4a4O88343 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc4a4O88343 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc4a4O88343 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc4a4O88343 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc4a4O88343 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc4a4O88343 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc4a4O88343 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc4a4O88343 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc4a4O88343 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc4a4O88343 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc4a4O88343 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc4a4O88343 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc4a4O88343 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Slc4a4O88343 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Slc4a4O88343 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc4a4O88343 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc4a4O88343 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc4a4O88343 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc4a4O88343 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc4a4O88343 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc4a4O88343 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc4a4O88343 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc4a4O88343 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc4a4O88343 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc4a4O88343 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc4a4O88343 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Slc4a4O88343 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc4a4O88343 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Slc4a4O88343 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Slc4a4O88343 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc4a4O88343 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Slc4a4O88343 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc4a4O88343 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc4a4O88343 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc4a4O88343 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc4a4O88343 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc4a4O88343 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc4a4O88343 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc4a4O88343 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc4a4O88343 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc4a4O88343 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc4a4O88343 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc4a4O88343 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc4a4O88343 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms