Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
KDM4AO75164 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms