Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vamp4O70480 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vamp4O70480 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vamp4O70480 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vamp4O70480 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Vamp4O70480 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vamp4O70480 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Vamp4O70480 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vamp4O70480 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vamp4O70480 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vamp4O70480 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vamp4O70480 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Vamp4O70480 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vamp4O70480 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vamp4O70480 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vamp4O70480 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vamp4O70480 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vamp4O70480 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vamp4O70480 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vamp4O70480 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vamp4O70480 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vamp4O70480 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vamp4O70480 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vamp4O70480 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vamp4O70480 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vamp4O70480 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vamp4O70480 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vamp4O70480 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vamp4O70480 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vamp4O70480 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vamp4O70480 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vamp4O70480 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vamp4O70480 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vamp4O70480 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vamp4O70480 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vamp4O70480 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vamp4O70480 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vamp4O70480 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vamp4O70480 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Vamp4O70480 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vamp4O70480 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vamp4O70480 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vamp4O70480 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vamp4O70480 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vamp4O70480 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vamp4O70480 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vamp4O70480 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vamp4O70480 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vamp4O70480 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vamp4O70480 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vamp4O70480 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vamp4O70480 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vamp4O70480 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vamp4O70480 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vamp4O70480 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Vamp4O70480 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vamp4O70480 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vamp4O70480 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vamp4O70480 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vamp4O70480 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vamp4O70480 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vamp4O70480 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vamp4O70480 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vamp4O70480 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vamp4O70480 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vamp4O70480 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vamp4O70480 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vamp4O70480 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vamp4O70480 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vamp4O70480 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Vamp4O70480 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Vamp4O70480 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vamp4O70480 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vamp4O70480 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vamp4O70480 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vamp4O70480 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vamp4O70480 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vamp4O70480 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vamp4O70480 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vamp4O70480 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Vamp4O70480 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vamp4O70480 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vamp4O70480 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vamp4O70480 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vamp4O70480 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vamp4O70480 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Vamp4O70480 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vamp4O70480 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Vamp4O70480 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vamp4O70480 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vamp4O70480 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vamp4O70480 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vamp4O70480 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vamp4O70480 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vamp4O70480 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vamp4O70480 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vamp4O70480 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vamp4O70480 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vamp4O70480 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vamp4O70480 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms