Protein–RNA interactions for Protein: O60832

DKC1, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKC1O60832 LIN7A-203ENST00000552093 546 ntTSL 35.45□□□□□ -1.543e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.573e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 DCAF6-212ENST00000491067 536 ntTSL 35.01□□□□□ -1.612e-11■■■■■ 27.9
DKC1O60832 PIP5K1C-207ENST00000636612 153 ntTSL 54.4□□□□□ -1.713e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.743e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 LRRC8D-204ENST00000441269 905 ntTSL 33.74□□□□□ -1.815e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 DCAF6-209ENST00000470919 827 ntTSL 23.52□□□□□ -1.852e-11■■■■■ 27.9
DKC1O60832 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.93e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 TNS1-204ENST00000413554 1478 ntTSL 515.93■□□□□ 0.144e-7■■■■■ 27.9
DKC1O60832 TNS1-214ENST00000479185 2513 ntTSL 513.64□□□□□ -0.234e-7■■■■■ 27.9
DKC1O60832 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.281e-7■■■■■ 27.8
DKC1O60832 PDXK-212ENST00000470029 583 ntTSL 321.88■■□□□ 1.091e-7■■■■■ 27.8
DKC1O60832 PDXK-207ENST00000438837 342 ntTSL 39.63□□□□□ -0.871e-7■■■■■ 27.8
DKC1O60832 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.239e-14■■■■■ 27.8
DKC1O60832 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.219e-14■■■■■ 27.8
DKC1O60832 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.099e-14■■■■■ 27.8
DKC1O60832 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.949e-14■■■■■ 27.8
DKC1O60832 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.789e-14■■■■■ 27.8
DKC1O60832 FGFR1-222ENST00000487647 1608 ntTSL 1 (best)16.37■□□□□ 0.219e-14■■■■■ 27.8
DKC1O60832 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.149e-14■■■■■ 27.8
DKC1O60832 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.19e-14■■■■■ 27.8
DKC1O60832 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.069e-14■■■■■ 27.8
DKC1O60832 FGFR1-211ENST00000425967 5375 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.149e-14■■■■■ 27.8
DKC1O60832 FGFR1-207ENST00000397103 2953 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.279e-14■■■■■ 27.8
DKC1O60832 FGFR1-208ENST00000397108 2870 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.469e-14■■■■■ 27.8
DKC1O60832 FGFR1-209ENST00000397113 3680 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.79e-14■■■■■ 27.8
DKC1O60832 FGFR1-235ENST00000530701 276 ntTSL 1 (best)2.29□□□□□ -2.049e-14■■■■■ 27.8
DKC1O60832 PLXNB1-209ENST00000466353 626 ntTSL 320.95■□□□□ 0.942e-10■■■■■ 27.7
DKC1O60832 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.322e-10■■■■■ 27.7
DKC1O60832 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.022e-10■■■■■ 27.7
DKC1O60832 TRAPPC9-211ENST00000521700 548 ntTSL 320.05■□□□□ 0.85e-7■■■■■ 27.5
DKC1O60832 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.551e-8■■■■■ 27.5
DKC1O60832 RAB3GAP1-201ENST00000264158 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.722e-25■■■■■ 27.4
DKC1O60832 RAB3GAP1-203ENST00000442034 4185 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.82e-25■■■■■ 27.4
DKC1O60832 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.452e-25■■■■■ 27.4
DKC1O60832 RAB3GAP1-204ENST00000487003 3506 ntTSL 55.96□□□□□ -1.452e-25■■■■■ 27.4
DKC1O60832 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.912e-25■■■■■ 27.4
DKC1O60832 CNOT6L-208ENST00000515506 4024 ntTSL 510.87□□□□□ -0.679e-8■■■■■ 27.4
DKC1O60832 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.171e-323■■■■■ 27.4
DKC1O60832 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.261e-323■■■■■ 27.4
DKC1O60832 CNOT1-211ENST00000567188 7830 ntTSL 1 (best)6.43□□□□□ -1.381e-323■■■■■ 27.4
DKC1O60832 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.631e-323■■■■■ 27.4
DKC1O60832 GNG7-201ENST00000382159 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.192e-6■■■■■ 27.4
DKC1O60832 GNG7-202ENST00000587867 723 ntTSL 510.59□□□□□ -0.712e-6■■■■■ 27.4
DKC1O60832 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.248e-8■■■■■ 27.4
DKC1O60832 CAMSAP1-202ENST00000389532 7696 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.28e-8■■■■■ 27.4
DKC1O60832 CAMSAP1-201ENST00000312405 6054 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.338e-8■■■■■ 27.4
DKC1O60832 MREG-204ENST00000439791 576 ntTSL 46.19□□□□□ -1.422e-7■■■■■ 27.4
DKC1O60832 MREG-203ENST00000424992 560 ntTSL 55.67□□□□□ -1.52e-7■■■■■ 27.4
DKC1O60832 MREG-202ENST00000420348 584 ntTSL 45.05□□□□□ -1.62e-7■■■■■ 27.4
DKC1O60832 RPL4-202ENST00000561554 580 ntTSL 412.13□□□□□ -0.471e-323■■■■■ 27.3
DKC1O60832 RPL4-213ENST00000566624 819 ntTSL 211.8□□□□□ -0.521e-323■■■■■ 27.3
DKC1O60832 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC7.23□□□□□ -1.251e-323■■■■■ 27.3
DKC1O60832 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.535e-7■■■■■ 27.3
DKC1O60832 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.725e-6■■■■■ 27.2
DKC1O60832 PVT1-218ENST00000523328 343 ntTSL 1 (best)25.39■■□□□ 1.661e-6■■■■■ 27.2
DKC1O60832 PVT1-220ENST00000524165 458 ntTSL 219.4■□□□□ 0.71e-6■■■■■ 27.2
DKC1O60832 MKKS-201ENST00000347364 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.144e-16■■■■■ 27.2
DKC1O60832 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.474e-16■■■■■ 27.2
DKC1O60832 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.644e-16■■■■■ 27.2
DKC1O60832 ULK4-201ENST00000301831 4613 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.415e-9■■■■■ 27.2
DKC1O60832 RHOT1-210ENST00000581094 3231 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.594e-18■■■■■ 27.1
DKC1O60832 RHOT1-208ENST00000580976 567 ntTSL 44.89□□□□□ -1.634e-18■■■■■ 27.1
DKC1O60832 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.491e-8■■■■■ 27
DKC1O60832 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.271e-8■■■■■ 27
DKC1O60832 EP400-205ENST00000389562 12836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.775e-10■■■■■ 26.8
DKC1O60832 EP400-204ENST00000389561 12317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.875e-10■■■■■ 26.8
DKC1O60832 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.958e-10■■■■■ 26.8
DKC1O60832 SRCIN1-211ENST00000612431 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)25.97■■□□□ 1.758e-7■■■■■ 26.8
DKC1O60832 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.496e-11■■■■■ 26.8
DKC1O60832 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.286e-11■■■■■ 26.8
DKC1O60832 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.26e-11■■■■■ 26.8
DKC1O60832 PALM-211ENST00000633534 879 ntTSL 322.06■■□□□ 1.126e-11■■■■■ 26.8
DKC1O60832 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.016e-11■■■■■ 26.8
DKC1O60832 PALM-210ENST00000593172 2489 ntTSL 221.19■□□□□ 0.986e-11■■■■■ 26.8
DKC1O60832 PALM-206ENST00000589012 579 ntTSL 320.46■□□□□ 0.876e-11■■■■■ 26.8
DKC1O60832 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.86e-11■■■■■ 26.8
DKC1O60832 PALM-205ENST00000587513 2290 ntTSL 419.83■□□□□ 0.766e-11■■■■■ 26.8
DKC1O60832 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.516e-11■■■■■ 26.8
DKC1O60832 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.378e-7■■■■■ 26.8
DKC1O60832 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.296e-11■■■■■ 26.8
DKC1O60832 VRK3-212ENST00000596814 1736 ntTSL 216.37■□□□□ 0.216e-11■■■■■ 26.8
DKC1O60832 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.116e-11■■■■■ 26.8
DKC1O60832 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.056e-11■■■■■ 26.8
DKC1O60832 IWS1-201ENST00000295321 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.026e-11■■■■■ 26.8
DKC1O60832 AC090907.2-201ENST00000559857 720 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.057e-6■■■■■ 26.8
DKC1O60832 VRK3-209ENST00000594948 1847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.176e-11■■■■■ 26.8
DKC1O60832 VRK3-202ENST00000377011 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.256e-11■■■■■ 26.8
DKC1O60832 VRK3-223ENST00000601341 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.346e-11■■■■■ 26.8
DKC1O60832 SORCS2-204ENST00000511199 532 ntTSL 49.87□□□□□ -0.833e-6■■■■□ 26.7
DKC1O60832 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.522e-6■■■■□ 26.7
DKC1O60832 ZYX-205ENST00000446634 926 ntTSL 521.13■□□□□ 0.972e-6■■■■□ 26.7
DKC1O60832 ZYX-204ENST00000436448 632 ntTSL 420.1■□□□□ 0.812e-6■■■■□ 26.7
DKC1O60832 ZYX-202ENST00000354434 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 216.21■□□□□ 0.192e-6■■■■□ 26.7
DKC1O60832 ZYX-203ENST00000392910 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.082e-6■■■■□ 26.7
DKC1O60832 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.121e-323■■■■□ 26.7
DKC1O60832 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.041e-323■■■■□ 26.7
DKC1O60832 RPS20-203ENST00000519369 824 ntTSL 215.14■□□□□ 0.011e-323■■■■□ 26.7
DKC1O60832 RPS20-208ENST00000521262 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.141e-323■■■■□ 26.7
DKC1O60832 RPS20-209ENST00000521289 737 ntTSL 512.3□□□□□ -0.441e-323■■■■□ 26.7
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