Protein–RNA interactions for Protein: O35253

Smad7, Mothers against decapentaplegic homolog 7, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad7O35253 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad7O35253 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad7O35253 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad7O35253 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad7O35253 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad7O35253 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad7O35253 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad7O35253 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad7O35253 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad7O35253 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad7O35253 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad7O35253 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms