Protein–RNA interactions for Protein: O00409

FOXN3, Forkhead box protein N3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3O00409 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXN3O00409 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXN3O00409 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXN3O00409 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXN3O00409 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXN3O00409 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXN3O00409 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXN3O00409 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXN3O00409 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXN3O00409 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXN3O00409 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXN3O00409 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXN3O00409 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXN3O00409 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXN3O00409 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXN3O00409 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXN3O00409 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXN3O00409 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXN3O00409 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXN3O00409 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXN3O00409 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXN3O00409 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXN3O00409 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXN3O00409 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXN3O00409 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXN3O00409 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXN3O00409 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXN3O00409 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXN3O00409 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXN3O00409 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXN3O00409 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXN3O00409 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXN3O00409 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms