Protein–RNA interactions for Protein: J3QNS5

Mfsd4b4, Major facilitator superfamily domain-containing 4B4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4b4J3QNS5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms