Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm8444F6XS56 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm8444F6XS56 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm8444F6XS56 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm8444F6XS56 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm8444F6XS56 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm8444F6XS56 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm8444F6XS56 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm8444F6XS56 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm8444F6XS56 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm8444F6XS56 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm8444F6XS56 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm8444F6XS56 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm8444F6XS56 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm8444F6XS56 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm8444F6XS56 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm8444F6XS56 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm8444F6XS56 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm8444F6XS56 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm8444F6XS56 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm8444F6XS56 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm8444F6XS56 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm8444F6XS56 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm8444F6XS56 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm8444F6XS56 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm8444F6XS56 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm8444F6XS56 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm8444F6XS56 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm8444F6XS56 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm8444F6XS56 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm8444F6XS56 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm8444F6XS56 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm8444F6XS56 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm8444F6XS56 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm8444F6XS56 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm8444F6XS56 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm8444F6XS56 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm8444F6XS56 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm8444F6XS56 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm8444F6XS56 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm8444F6XS56 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm8444F6XS56 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm8444F6XS56 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm8444F6XS56 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm8444F6XS56 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm8444F6XS56 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm8444F6XS56 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm8444F6XS56 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm8444F6XS56 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms