Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm20425E9Q035 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm20425E9Q035 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm20425E9Q035 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm20425E9Q035 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm20425E9Q035 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm20425E9Q035 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm20425E9Q035 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm20425E9Q035 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm20425E9Q035 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm20425E9Q035 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm20425E9Q035 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm20425E9Q035 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm20425E9Q035 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm20425E9Q035 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm20425E9Q035 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm20425E9Q035 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm20425E9Q035 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm20425E9Q035 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm20425E9Q035 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm20425E9Q035 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm20425E9Q035 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm20425E9Q035 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm20425E9Q035 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm20425E9Q035 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm20425E9Q035 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm20425E9Q035 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm20425E9Q035 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm20425E9Q035 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm20425E9Q035 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm20425E9Q035 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm20425E9Q035 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm20425E9Q035 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm20425E9Q035 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm20425E9Q035 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm20425E9Q035 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm20425E9Q035 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm20425E9Q035 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm20425E9Q035 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm20425E9Q035 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm20425E9Q035 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm20425E9Q035 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm20425E9Q035 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm20425E9Q035 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm20425E9Q035 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm20425E9Q035 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm20425E9Q035 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm20425E9Q035 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm20425E9Q035 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm20425E9Q035 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm20425E9Q035 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm20425E9Q035 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm20425E9Q035 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm20425E9Q035 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm20425E9Q035 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm20425E9Q035 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm20425E9Q035 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm20425E9Q035 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm20425E9Q035 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm20425E9Q035 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm20425E9Q035 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm20425E9Q035 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm20425E9Q035 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm20425E9Q035 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm20425E9Q035 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm20425E9Q035 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm20425E9Q035 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm20425E9Q035 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm20425E9Q035 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm20425E9Q035 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm20425E9Q035 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm20425E9Q035 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm20425E9Q035 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm20425E9Q035 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.6 ms