Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trappc8E9PWG2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trappc8E9PWG2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trappc8E9PWG2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trappc8E9PWG2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trappc8E9PWG2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trappc8E9PWG2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trappc8E9PWG2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trappc8E9PWG2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trappc8E9PWG2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Trappc8E9PWG2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Trappc8E9PWG2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trappc8E9PWG2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trappc8E9PWG2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trappc8E9PWG2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trappc8E9PWG2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trappc8E9PWG2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trappc8E9PWG2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trappc8E9PWG2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trappc8E9PWG2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trappc8E9PWG2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trappc8E9PWG2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trappc8E9PWG2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trappc8E9PWG2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trappc8E9PWG2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trappc8E9PWG2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC27.58■■■□□ 2
Trappc8E9PWG2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
Trappc8E9PWG2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Trappc8E9PWG2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trappc8E9PWG2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trappc8E9PWG2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Trappc8E9PWG2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trappc8E9PWG2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Trappc8E9PWG2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Trappc8E9PWG2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Trappc8E9PWG2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Trappc8E9PWG2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Trappc8E9PWG2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Trappc8E9PWG2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trappc8E9PWG2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trappc8E9PWG2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trappc8E9PWG2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trappc8E9PWG2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trappc8E9PWG2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Trappc8E9PWG2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trappc8E9PWG2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Trappc8E9PWG2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Trappc8E9PWG2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Trappc8E9PWG2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Trappc8E9PWG2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Trappc8E9PWG2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Trappc8E9PWG2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Trappc8E9PWG2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Trappc8E9PWG2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Trappc8E9PWG2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Trappc8E9PWG2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Trappc8E9PWG2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Trappc8E9PWG2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Trappc8E9PWG2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Trappc8E9PWG2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Trappc8E9PWG2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Trappc8E9PWG2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Trappc8E9PWG2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Trappc8E9PWG2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Trappc8E9PWG2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Trappc8E9PWG2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trappc8E9PWG2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Trappc8E9PWG2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Trappc8E9PWG2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trappc8E9PWG2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trappc8E9PWG2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Trappc8E9PWG2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Trappc8E9PWG2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Trappc8E9PWG2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trappc8E9PWG2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Trappc8E9PWG2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Trappc8E9PWG2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Trappc8E9PWG2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Trappc8E9PWG2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trappc8E9PWG2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Trappc8E9PWG2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trappc8E9PWG2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trappc8E9PWG2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trappc8E9PWG2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trappc8E9PWG2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trappc8E9PWG2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Trappc8E9PWG2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trappc8E9PWG2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trappc8E9PWG2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trappc8E9PWG2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trappc8E9PWG2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trappc8E9PWG2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trappc8E9PWG2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trappc8E9PWG2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trappc8E9PWG2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trappc8E9PWG2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Trappc8E9PWG2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trappc8E9PWG2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trappc8E9PWG2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trappc8E9PWG2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms